В 2001 году коллекция была распределена на три части, на основе заключения экспертной комиссии из ведущих искусствоведов страны, специализирующихся на непрофессиональном искусстве. Большая и самая ценная часть собрания ЗНУИ была передана в ГРДНТ.

Учителями этих творцов в 1960-1980-х гг. были художники андеграунда, представители левого крыла МОСХа, которых исключили из Союза Художников после выставки «Новая реальность» в Манеже в 1962 году. Этот синтез неофициального и непрофессионального творчества породил феномен советского наивного искусства. В раздел входят как значимые, много раз экспонируемые произведения, так и учебные рисунки, наброски и эскизы, на обратной стороне которых содержатся комментарии учеников и их учителей, а также информация об учебном задании.

Самыми признанными из них являются: П.П.Леонов, И.Е.Селиванов, А.И.Канцуров, А.П.Кашигин, Г.Л.Иванов, В.Г.Аносов, А.А.Белых, В.И.Бранковская, Е.А.Волкова, Е.Н.Фроленкова, А.Г.Тяпкина.

Творчеству этих художников посвящены многочисленные монографии, сборники статей, статьи, альбомы-каталоги, фильмы, энциклопедии и словари, имена некоторых из них вошли во Всемирную энциклопедию наивного искусства.